Giải mã và phân tích đặc điểm gen UL5 của virus dịch tả vịt tại Việt Nam

Tóm tắt

Virus dịch tả vịt (DEV) là tác nhân gây ra bệnh truyền nhiễm cấp tính, lây lan nhanh với tỷ lệ chết cao cho loài thủy cầm ở mọi lứa tuổi. Trong nghiên cứu này, toàn bộ gen helicase UL5 của hai chủng virus dịch tả vịt tại Việt Nam, bao gồm một chủng cường độc (kí hiệu là DTVCDKN) và một chủng nhược độc vacxin (kí hiệu là DTVVXKN) do Trung tâm kiểm nghiệm thuốc thú y Trung ương I cung cấp đã được dòng hóa vào vector tách dòng và giải trình trình tự bao gồm 2568 nucleotide mã hóa cho 856 amino acid. Thành phần cấu trúc gen UL5 của các chủng virus dịch tả vịt Việt Nam gồm có: 769 adenine (29,95%), 556 cytosine (21,65%), 533 guanine (20,76%) và 710 thymine (27,65%). Kết quả so sánh giữa gen UL5 của chủng virus cường độc và chủng virus nhược độc vacxin Việt Nam với gen UL15 của các chủng DEV đăng ký trên Ngân hàng gen thế giới cho thấy mức tương đồng của chúng là 100%, trong khi có 9 vị trí sai khác về nucleotide, dẫn đến 4 vị trí sai khác về amino acid khi so sánh giữa 2 chủng virus của Việt Nam với các chủng của thế giới. Đây là công bố đầu tiên về giải mã gen virus dịch tả vịt tại Việt Nam.