VỊ TRÍ PHÂN LOẠI CỦA CÁC CHỦNG CLOSTRIDIUM PERFRINGENS PHÂN LẬP TẠI VIỆT NAM DỰA VÀO TRÌNH TỰ GEN 16S rRNA

  • Lê Lập và cs

Tóm tắt

TÓM TẮT

Trình tự nucleotid đoạn 645bp trên 16S rRNA của 5 chủng C.perfringens phân lập từ dê, cừu mắc bệnh viêm ruột tiêu chảy tại Việt Nam có mức tương đồng cao (99,8-100%); trong đó trình tự gen 16S rRNA của 3 chủng: CD4 (typ D) phân lập từ miền Bắc, DKH (typ D) phân lập tại Khánh Hòa và CV58 (typ A) phân lập từ Ninh Thuận là hoàn toàn giống nhau (100%), chứng tỏ gen này có độ bảo tồn và tương đồng rất cao giữa các chủng C.perfringens với typ độc tố khác nhau và ở các vùng địa lý khác nhau; giữa các chủng còn lại (CV58, CV135 và typ C) sự khác biệt chỉ là 1 nucleotid, hay độ tương đồng 99,8%. Khác biệt này có thể được xem là do đột biến điểm ngẫu nhiên, như vậy có thể kết luận đoạn 645 bp mã hóa cho 16S rRNA của các chủng phân lập tại Việt Nam là giống nhau. Phân tích cây phả hệ dựa vào so sánh trình tự gen 16S rRNA của các loài trong giống Clostridium  (Collins và cs., 1994; Sasaki và cs., 2001, 2002), các chủng phân lập tại Việt Nam có vị trí thuộc giống Clostridium, cụm I (Cluster I), nhóm I-a (Clade I-a), loài C.perfringens.

Từ khóa: Dê, cừu, Clostridium perfringens, Giải trình tự gen 16S rRNA, Vị trí phân loại, Việt Nam

điểm /   đánh giá
Phát hành ngày
2013-03-12
Chuyên mục
Nghiên cứu khoa học