Phân tích di truyền của virut viêm não Nhật Bản chủng CTMP-7

Tóm tắt

Tóm tắt

Nghiên cứu phân tích trình tự gen E của virut viêm não Nhật Bản chủng CTMP-7 phân lập từ muỗi tại thành phố Cần Thơ, đồng thời tìm hiểu mối quan hệ di truyền giữa chủng CTMP-7 với 52 chủng virut  VNNB tham chiếu phân lập tại Việt Nam và một số nước Châu Á. Kết quả nghiên cứu cho thấy virut VNNB chủng CTMP-7 thuộc genotype 1, có mức độ tương đồng cao 94-96% với các chủng LAH-2097- 05 và LA-H07-05 (Long An), chủng VN22 (miền Bắc Việt Nam),  chủng JE-KK-116 (Thái Lan), chủng M859 (Campuchia), chủng SC04-17  (Trung Quốc),  JaNar17-07 và JEV-254 (Nhật Bản), tính tương đồng thấp hơn  ở mức 87% với chủng RFVL (Nhật Bản) và 84% với chủng JKT9092 (Indonesia)  nhưng  không có biến đổi lớn về trình tự amino acid (≤6%).

       Từ khóa: Virut VNNB, Chủng CTMP-7, Gen E, Giải trình tự, Phân tích quan hệ di truyền