SÀNG LỌC CÁC FLAVONOIDS GẮN KẾT PROTEIN LIÊN KẾT PENICILLIN 4 ĐÓNG VAI TRÒ ỨC CHẾ STAPHYLOCOCCUS AUREUS KHÁNG METHICILLIN

Tóm tắt

Staphylococcus aureus kháng methicillin (MRSA) là mầm bệnh nguy hiểm gây ra nhiều bệnh truyền nhiễm nghiêm trọng ở người. Hiện tượng dung nạp thuốc, kháng thuốc và rối loạn vi khuẩn tăng nhanh do lạm dụng kháng sinh đang cản trở hiệu quả của các liệu pháp kháng sinh hiện đại chủ yếu được sử dụng để điều trị mầm bệnh phổ biến trên toàn thế giới này. Protein liên kết penicillin 4 (PBP4) là một loại enzyme vi khuẩn thuộc về họ protein gắn penicillin. Enzyme này đóng một vai trò quan trọng trong quá trình sinh tổng hợp và duy trì thành tế bào vi khuẩn, điều cần thiết cho sự sống của vi khuẩn. Trong nghiên cứu này, chúng tôi áp dụng phương pháp mô phỏng tương tác phân tử để tìm ra các flavonoid có khả năng liên kết với vị trí xúc tác của PBP4. Kết quả cho thấy 39 flavonoid có ái lực liên kết mạnh hơn với PBP4 so với phối tử đồng kết tinh. Trong số đó, năm hợp chất có ái lực gắn kết mạnh nhất là Umbralisib, Quercitrin, Isosilybin, Kaempferol-3-O-rutinoside và Eriocitrin. Đáng chú ý, Umbralisib cho thấy ái lực liên kết mạnh nhất (-11.05 kcal/mol), và tạo thành hai liên kết hydro với các axit amin Ser262, Ser75 và bốn tương tác kỵ nước tại các axit amin Phe241, Ala182, Leu115 và Tyr291. Kết quả đạt được sẽ cung cấp những thông tin cơ bản thiết thực cho những nghiên cứu sâu hơn sau này về việc ứng dụng các hợp chất từ trong điều trị hoặc hỗ trợ điều trị nhiễm khuẩn MRSA trong tương lai.