XÁC ĐỊNH MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM CẤU TRÚC, VỊ TRÍ VÀ PHÂN NHÓM CỦA CÁC PROTEIN VẬN CHUYỂN ĐƯỜNG SUCROSE HỌ SWEET Ở CÂY DIÊM MẠCH (CHENOPODIUM QUINOA) BẰNG CÁC CÔNG CỤ TIN SINH HỌC

DOI: 10.18173/2354-1059.2021-0082

  • Phạm Phương Thu
  • Chu Đức Hà
  • Nguyễn Sông Thao
  • Trần Thị Thanh Huyền
Từ khóa: Chenopodium quinoa, diêm mạch, SWEET, tính chất lý hoá, tin sinh học

Tóm tắt

Trong nghiên cứu này, 29 thành viên của nhóm protein CqSWEET trên cây diêm mạch (Chenopodium quinoa) đã được phân tích bằng các công cụ tin sinh học một cách toàn diện. Theo đó, các protein CqSWEET có kích thước đạt từ 161 - 428 axít amin (17,7 - 47,7 kDa). Giá trị điểm đẳng điện của các protein CqSWEET dao động từ ngưỡng axít (4,9) đến bazơ (9,7), trong khi đa số thành viên của nhóm CqSWEET có tính ổn định trong ống nghiệm. Phân tích cho thấy nhóm CqSWEET có tính kỵ nước và rất nhiều protein có thể cư trú ở hệ thống bao gói. Dựa theo sơ đồ hình cây, các protein CqSWEET được phân loại thành 3 nhóm, tương tự như ở các loài thực vật khác. Phân tích cấu trúc cho thấy phần lớn các protein CqSWEET đều mang 6 hoặc 7 cấu trúc xoắn xuyên màng. Nghiên cứu đã ghi nhận 4 motif bảo thủ xuất hiện ở hầu hết các thành viên của nhóm CqSWEET. Kết quả của nghiên cứu này đã cung cấp những dẫn liệu quan trọng cho việc phân tích chức năng của gen CqSWEET ứng viên liên quan đến điều hòa sinh trưởng và phát triển của cây diêm mạch. 

điểm /   đánh giá
Phát hành ngày
2022-02-21
Chuyên mục
BAI BÁO