Đa dạng di truyền gen ORF5 của một số chủng virus PRRS phân lập từ năm 2011 đế năm 2013 tại miền bắc Việt Nam

Tóm tắt

Hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp ở lợn (PRRS) là một trong những nguyên nhân gây thiệt hại kinh tế quan trọng cho ngành chăn nuôi lợn ở Việt Nam. Việc phân tích về đa dạng di truyền của các chủng virus PRRS phân lập được ngoài thực địa đóng vai trò quan trọng trong việc xây dựng chiến lược phòng chống bệnh. Trong nghiên cứu này, 6 chủng virus PRRS đã được phân lập từ các mẫu bệnh phẩm thu thập được ngoài thực địa trong giai đoạn 2011 – 2013 và được giải trình tự và phân tích vùng gen ORF5. Kết quả phân tích về trình tự nucleotide (nt) và và amino acid (aa) của gen ORF5 cho thấy cả 6 chủng virus có mức độ tương đồng với nhau rất cao, tỷ lệ tương đồng về nt là 96,5 – 99,8% và về aa là 94,0 – 99,5%. Kết quả phân tích về cây phả hệ cho thấy cả 6 chủng virus đều thuộc dòng (type) Bắc Mỹ, nhánh (sub-lineage) 8.7.