So sánh tương đồng gen giữa các chủng PRRSV độc lực cao thu thập thực địa với các chủng vacxin thương mại

Tóm tắt

Ba đoạn gen NSP2, ORF5 và ORF7 của 36 chủng HP-PRRSV thu thập tại các ổ dịch thực địa trong các năm 2009 - 2014 từ nhiều tỉnh thành đã được giải trình tự và phân tích tương đồng gen so với các chủng vacxin thương mại có mặt trên thị trường. Ở gen ORF5, các chủng thực địa có mức tương đồng nucleotid/amino acid (%) lần lượt: 86,8-99,7/84,0-99,5; 89,0-93,8/83,2-96,9; 84,1-98,8/88,1-92,1; 83,7-98,8/83,8-97,4; 83,3-98,5/81,4-96,9; 42,6-46,2/46,8-51,1 và 42,3-45,5/42,3-47,7 tương ứng so với chủng vacxin JXA1-R, P129 Fostera, ATCC VR-2332 Ingelvac, Resp PRRS Ingelvac, BCL-PS 100, Amervac PRRS và Porcilis PRRS. Ở gen ORF7, các chủng thực địa có sự tương đồng nucleotid (%) lần lượt 91,1-99,7/94,7-99,1; 90,3-95,6/94,7-99,9; 90,6-99,7/94,7-99,9; 90,6-99,7/94,7-99,9; 41,9-46,0/52,8-55,8 và 42,3-46,1/52,8-56,9 so với chủng vacxin JXA1-R, P129 Fostera, ATCC VR-2332 Ingelvac, Resp PRRS Ingelvac, Amervac PRRS và Porcilis PRRS. Sự đa dạng cao của các chủng thực địa dựa trên phân tích ORF5 và ORF7 dẫn đến mức tương đồng biến động lớn so với các chủng vacxin, nên việc xác định chủng nhiễm trên đàn heo hay vùng chăn nuôi có giá trị cho việc chọn vacxin phù hợp và hiệu quả tốt hơn.