ĐẶC ĐIỂM CỦA VÙNG GENE trnL VÀ PHÂN TÍCH SỰ PHÁT SINH LOÀI Hoya parasitica (Roxb.) Wall. ex Wight

Tóm tắt

Ở thực vật, việc tìm kiếm mã vạch DNA đặc hiệu để định danh loài còn gặp nhiều khó khăn. Một số vùng gene lục lạp đã được nghiên cứu và đề xuất làm chỉ thị DNA sử dụng trong định danh loài. Vùng gene trnL trong hệ gene lục lạp gồm intron trnL(UAA) nằm giữa hai exon trong vùng sao chép đơn lớn và intron trnL(UAA) là vùng siêu biến. Hoya parasitica (Roxb.) Wight) thuộc chi Hoya là cây thảo dược quý. Lá H. parasitica đã được sử dụng để điều trị một số bệnh ở người. Vấn đề đặt ra là có thể sử dụng vùng gene trnL làm mã vạch để nhận diện loài H. parasitica khi các mẫu cây bị biến dạng hoặc ở dạng bột hay không? Nghiên cứu này trình bày kết quả xác định đặc điểm vùng gene trnLbằng phương pháp khuếch đại và giải trình tự nucleotide; phân tích sự tiến hóa phân tử bằng MEGAX; đồng thời đề xuất mã vạch tiềm năng để định danh loài H. parasitica. Kết quả phân lập và giải trình tự nucleotide cho thấy, vùng gene trnL có kích thước là 829 bp. Cây phát sinh gene được xây dựng dựa trên 32 trình tự trnL cho thấy các loài phân bố trong 5 nhóm và mẫu H. parasitica TN1 phân bố cùng một nhóm với H. pubicalyx. Vùng gene trnL được đề xuất là ứng cử viên mã vạch DNA lục lạp tiềm năng phục vụ nhận dạng loài H. parasitica.