ĐÁNH GIÁ HOẠT TÍNH IN SILICO CỦA MỘT SỐ CÁC HỢP CHẤT XANTHONE TỪ SINH VẬT BIỂN NHƯ CÁC CHẤT ỨC CHẾ PI3Kγ BẰNG PHƯƠNG PHÁP GẮN KẾT PHÂN TỬ

  • Cao Hồng Lê, Nguyễn Ngọc Thụy, Trương Thị Thùy Nhung, Bùi Thị Thực, Mạc Thị Nguyên, Nguyễn Trung Đức, Đậu Đình Khải, Đinh Thị Thùy Linh, Nguyễn Lan Hương
Từ khóa: Protein PI3Kγ; Xanthone từ sinh vật biển; Tham số AutoDock Vina; Austocystin L; Neocitreamicins I

Tóm tắt

Protein PI3Kγ là một đích kinase được xác định rõ trong điều trị ung thư, đóng vai trò quan trọng trong việc điều chỉnh tín hiệu tế bào, chuyển hóa, sự phát triển và sự sinh sản của tế bào. Nghiên cứu của chúng tôi nhằm đánh giá khả năng ức chế với PI3Kγ, và cách thức tác động của một loạt các dẫn xuất xanthone có hoạt tính sinh học từ nguồn sinh vật biển. Hiệu quả của phần mềm AutoDock Vina để dự đoán ái lực liên kết giữa phối tử và thụ thể cũng như vị trí của các hợp chất nghiên cứu đã được xác minh trước đó thông qua dữ liệu thực nghiệm có sẵn. Dựa trên các tham số AutoDock Vina đã được xác minh, một cơ sở dữ liệu gồm 169 xanthone từ sinh vật biển đã được sàng lọc đối với protein PI3Kγ. Các hợp chất tự nhiên có ái lực liên kết thấp hơn (ΔG = -9,12 kcal/mol) so với chất đối chứng dương đã được phân tích để đánh giá sự tương tác giữa các hợp chất nghiên cứu với protein PI3Kγ. Phân tích cấu trúc và năng lượng cho thấy rằng Austocystin L rất ổn định trong các vị trí hoạt động của protein PI3Kγ. Austocystin L và Neocitreamicins I được đề xuất làm tác nhân chống lại protein PI3Kγ và để định hướng thêm cho các thực nghiệm sinh hóa dựa trên tính toán in silico.

điểm /   đánh giá
Phát hành ngày
2024-03-12
Chuyên mục
Khoa học Tự nhiên - Kỹ thuật - Công nghệ (TNK)