PHÂN TÍCH MỐI QUAN HỆ DI TRUYỀN CỦA DÒNG THANH NHÃN BẠC LIÊU VỚI CÁC GIỐNG NHÃN ĐỊA PHƯƠNG DỰA TRÊN CHỈ THỊ ITS

GENETIC RELATIONSHIP ANALYSIS OF THE “THANH NHAN” LONGAN LINE FROM BAC LIEU AND LOCAL LONGAN VARIETIES BASED ON ITS MARKERS

Tóm tắt

Thí nghiệm xác định mối quan hệ di truyền giữa Thanh nhãn Bạc Liêu và một số giống nhãn địa phương khác bằng chỉ thị phân tử ITS (Internal Transcribed Spacer). Thí nghiệm được khảo sát gồm 03 giống nhãn: (1) Giống Thanh nhãn Bạc Liêu; (2) Giống nhãn Giồng Bạc Liêu; (3) Giống nhãn Xuồng Cơm Vàng. Ba giống nhãn thí nghiệm có cùng độ tuổi (10 năm) và được trồng trên 3 khu đất liền kề nhau trong cùng một vườn trên đất Giồng cát Bạc Liêu có cùng điều kiện canh tác. Cây nhãn được khảo sát đang trong tình trạng phát triển tốt, không bị sâu bệnh. Kết quả cho thấy giữa 3 giống nhãn có sự khác biệt nhất định về trình tự các nucleotide và tỷ lệ các base; Mối quan hệ di truyền của dòng Thanh nhãn Bạc Liêu gần với giống nhãn Giồng Bạc Liêu hơn so với nhãn Xuồng Cơm Vàng; Sử dụng BLAST (Basic Local Alignmet Search Tool) để so sánh trình tự của 3 giống nhãn với trình tự hiện có trong ngân hàng dữ liệu trên NCBI (National Center for Biotechnology Informatio) cho thấy cả 3 giống nhãn có mối quan hệ gần nhau và có sự tương đồng khoảng 98% với Dimocarpus longan.  

ABSTRACT

The study is aimed at determining the genetic relationship between “Thanh Nhan” longan of Bac Lieu and other local longan varieties using ITS (Internal Transcribed Spacer) Molecular Markers. The experiment included three longan cultivars: (1) Thanh Nhan Bac Lieu, (2) Giong Bac Lieu, and (3) Xuong Com Vang. All experimental trees were of the same age (10 years) and were grown on three adjacent plots within the same orchard on sandy ridge soil in Bac Lieu Province under identical cultivation conditions. The surveyed longan trees were healthy, exhibited good growth, and were free from pests and diseases. The results showed that the three longan cultivars differed in nucleotide sequences and base composition. The genetic relationship of the Thanh Nhan Bac Lieu line was closer to the Giong Bac Lieu cultivar than to the Xuong Com Vang cultivar. BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) analysis comparing the ITS sequences of the three cultivars with sequences available in the NCBI (National Center for Biotechnology Information) database indicated that all three cultivars were closely related and shared approximately 98% sequence similarity with Dimocarpus longan.