DỰ ĐOÁN EPITOPE TẾ BÀO B KHÔNG LIÊN TỤC TRÊN PROTEIN MATRIX CỦA VIRUS H5N1

Tóm tắt

Mặc dù epitope không liên tục chiếm đến 90% trong tổng số các epitope tế bào B nhưng do các khó khăn trong việc phát triển các phương pháp dự đoán epitope không liên tục nên hiện nay các phương pháp dự đoán epitope tế bào B đa số đều tập trung vào việc dự đoán epitope liên tục. Để phục vụ cho việc phát triển văcxin phòng virus H5N1, chúng tôi đang tiến hành nghiên cứu dự đoán in silico các epitope liên tục liên quan đến tế bào T và tế bào B cũng như epitope không liên tục liên quan đến tế bào B của các kháng nguyên virus H5N1. Trong nghiên cứu này, bằng phương pháp mô hình hóa tương đồng, chúng tôi đã tạo được các cấu trúc của protein matrix của virus H5N1 từ đó dự đoán epitopes tế bào B không liên tục. 60 trong 72 amino acid đã dự đoán được là trùng hợp với kết quả dự đoán bởi phương pháp dự đoán epitope cấu hình của CEP (Conformational Epitope Prediction). Tất cả các amino acid dự đoán đều thuộc nhóm thích nước, phân cực, tích điện và nằm trên bề mặt cấu trúc của kháng nguyên.