Phân tích gen M mã hoá protein màng của virus gây bệnh "tai xanh" tại Việt Nam và so sánh với các chủng của Trung Quốc và thế giới

Tóm tắt

Toàn bộ chuỗi gen M của chủng virus gây bệnh "tai xanh" phân lập từ lợn bệnh tại Quảng Nam (Việt Nam) năm 2007, ký hiệu TXMT1 (VN), có độ dài 525 bp đã được thu nhận và giải trình tự. Thành phần nucleotide, amino acid gen M của chủng TXMT1 được sử dụng để phân tích và so sánh đồng nhất về nucleotide và tương đồng về amino acid giữa chủng này với một số chủng của Trung Quốc phân lập trong các năm 2006 - 2008 và thế giới. Chủng TXMT1 (Việt Nam) được xác định thuộc virus gây hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp ở lợn (PRRSV), type II (dòng Bắc Mỹ), có tỷ lệ đồng nhất (identity) về thành phần nucleotide và tỷ lệ tương đồng (homology) về amino acid rất cao (99-100%) với các chủng của Trung Quốc; thấp hơn (94% nucleotide; 96% amino acid) so với chủng VR2332 và rất thấp (69% nucleotide; 79% amino acid) so với chủng Lelystad. Chủng TXMT1 chỉ có 2 - 3 vị trí sai khác nucleotide với các chủng Trung Quốc, trong khi đó có đến 28 so với chủng VR2332 cổ điển (type II, dòng Bắc Mỹ) và rất nhiều so với các chủng châu Âu (type I). Sai khác V (valine)/I (isoleucine) ở vị trí 24 của chuỗi polypeptide M là nét đặc trưng giữa chủng TXMT1 với tất cả các chủng thuộc dòng Bắc Mỹ và châu Âu. Đặc tính gen M cho thấy, chủng TXMT1 của Việt Nam có biến đổi di truyền cao, có thể có cùng nguồn gốc phát sinh cùng với các chủng PRRSV của Trung Quốc, dẫn đến suy đoán, tác nhân gây PRRS cường độc cao này có tại Việt Nam rất có thể là do từ Trung Quốc vào