Xác định và đánh giá độ tương đồng về đặc điểm di truyền phân tử của Genotype của CPV -2 gây bệnh viêm ruột trên chó tại Tỉnh Tiền Giang

Tóm tắt

Canine Parvovirus type 2 (CPV-2) là một tác nhân gây bệnh quan trọng của chó nhà và chó hoang dã và đã lan rộng trên toàn thế giới kể từ khi nó xuất hiện vào những năm 1970, là một trong những mầm bệnh chủ yếu gây bệnh viêm ruột trên chó nuôi. Mặc dù gần đây có một vài nghiên cứu về sự lưu hành của CPV-2 tại Việt Nam, nhưng thông tin về đặc điểm di truyền học phân tử của các genotype của CPV-2 hiện nay vẫn còn rất hạn chế. Để kiểm tra và đánh giá mức tương đồng về đặc điểm di truyền học phân tử của các genotype của CPV-2 lưu hành trên đàn chó, gen VP2 của 40 mẫu bệnh phẩm Canine Parvovirus tại tỉnh Tiền Giang được thu nhận và giải trình tự bằng phương pháp Sanger trên hệ thống ABI 3130 (Mỹ) và kiểm tra trình tự thu nhận được bằng phần mềm BioEdit. Kết quả đối chiếu 40 genotype của CPV-2 nghiên cứu với genotype của CPV-2 ban đầu cho thấy có 39 genotype của CPV-2 có sự đột biến đồng nhất tại 4 vị trí nucleotide trên bộ gen của CPV-2 ở các vị trí 2773T, 2816C, 3790G và 3792A, được xác định là genotype CPV-2c; chỉ có 1 genotype
của CPV-2 trong nghiên cứu này có sự đột biến tại 3 vị trí nucleotide trên bộ gen của CPV-2 ở các vị trí số 2773T, 2816C và 2817C, được xác định là genotype CPV-2a. Chọn lựa 8 genotype CPV-2c và CPV-2a trong nghiên cứu có kết quả rõ, đẹp và đối chiếu với genotype CPV-2c và CPV-2a trên mẫu tham chiếu thấy có sự tương đồng về thành phần nucleotide và amino acid; đồng thời có sự tương đồng cao về đặc điểm di truyền học phân tử giữa các genotype của CPV-2 nghiên cứu tại tỉnh Tiền Giang với nhau; với các genotype trên Ngân hàng gen (GenBank, NCBI), với các genotype trong các vacxin trên Ngân hàng gen.