Phân tích trình tự một phần gen nucleoprotein (N) của chủng virus dại tại Hà Tiên, Kiên Giang

Tóm tắt

Nghiên cứu này được thực hiện với mục đích xác định đặc điểm của virus dại (chi Lyssavirus,
họ Rhabdoviridae, bộ Mononegavirales) bằng cách giải trình tự một phần gen nucleoprotein (N) để
biết kiểu gen và phát sinh loài của chủng virus dại 1230.2019 phát hiện trên một chó mắc bệnh dại ở
Hà Tiên, tỉnh Kiên Giang, Việt Nam. Mẫu não được thu, vô trùng từ chó chết để phát hiện virus dại.
Mẫu này đã được phát hiện dương tính bằng phương pháp RT-PCR và giải trình tự cho nồng độ sản
phẩm gen tốt.
Trình tự nucleotide và trình tự amino acid của chủng vi khuẩn dại 1230.2019 với các chủng virus
dại tham chiếu có mức độ giống nhau lần lượt là 95,20–100% và 92,00–100%. Chủng virus dại
1230.2019 ở chó bệnh Hà Tiên (Việt Nam) cùng quan hệ di truyền với 8 chủng virus dại tham chiếu
trong nghiên cứu. Chủng 1230.2019 có kết quả phân tích khoảng cách di truyền (0-0,16%) rất gần
với 5 chủng virus dại vacxin tham chiếu và ba chủng virus dại ở chó bệnh ở GenBank. Phả hệ dựa
vào chuỗi gen nucleoprotein (N), chủng 1230.2019 có mức độ đồng nhất gần như tuyệt đối và tương
đồng cao với chủng vacxin Pháp 93127FRA (vacxin RABISIN ngừa dại đang được sử dụng rộng rãi
ở Việt Nam).