Đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng lạc đột biến mới chọn tạo bằng chỉ thị SSR
Tóm tắt
Mười một cặp mồi SSR đã được sử dụng để đánh giá mức độ sai khác ADN của 24 dòng lạc đột biến (8 dòng có nguồn gốc từgiống VD2 và 16 dòng có nguồn gốc từ giống L9801). Kết quả phân tích sản phẩm PCR-SSR trên gel polyacrylamide 6% cho thấy, trong số11 cặp mồi SSR, tám cặp mồi (L25, L29, L32, L36, L41, L43, L50 và L54) cho tính đa hình với giá trị PIC dao động từ 0,44 (L41) đến 0,85 (L32). Trong đó, 7/8 cặp mồi cho tính đa hình cao với giá trị PIC ≥0,5 (chiếm 87,5%). Số lượng các phân đoạn ADN được nhân bản với mỗi mồi xê dịch từ 1 đến 9 trong phạm vi quan sát. Kích thước các phân đoạn ADN nhân bản nằm trong khoảng từ 120 bp đến 360 bp. Mức độ sai khác di truyền của tám dòng lạc đột biến từ giống gốc VD2 khi phân tích với 11 cặp mồi SSR cho thấy, tất cả 8 dòng lạc đột biến đều có sự sai khác di truyền so với giống gốc. Hệ số sai khác di truyền giữa các dòng lạc đột biến dao động từ 0% đến 37% (1 - 0,63), trong đó ba dòng lạc VD2-1-1, VD2-1-2 và VD2-1-3 giống nhau về mặt di truyền (trong đó VD2-1-1 và VD2-1-2 là hai hạt của cùng một quả, còn VD2-1-1, VD2-1-2 và VD2-1-3 là các hạt không cùng một quả) và có hệ số sai khác với giống gốc ít nhất khoảng 4% (1 - 0,96), dòng VD2-2-3 và VD2-2-4 lại có sự sai khác nhiều nhất so với giống gốc khoảng 27% (1 - 0,63). Xác định mức độ sai khác phân tử của các dòng lạc đột biến thế hệ M3 từ giống gốc L9801, tất cả16 dòng lạc đột biến đều có sự sai di truyền so với giống gốc L9801. Hệ sốdi truyền sai khác giữa các dòng lạc đột biến từ giống L9801 dao động từ0% (1 - 1) đến 45% (1 - 0,55). Dòng lạc L9801-2-2 có hệ số sai khác di truyền ít nhất so với giống gốc L9801 khoảng 0,9% (1 - 0,91). Trong khi đó 2 dòng L9801-3-3 và L9801-3-4 lại có sựsai di truyền nhiều nhất so với giống gốc khoảng 45% (1-0,55). Sơ đồ hình cây chia làm 2 nhóm: Nhóm I bao gồm hai dòng L9801-3-3 và L9801-3-4 là hai hạt của cùng một quả nhưng có sự sai khác di truyền là khoảng 12 % (1 - 0,88). Nhóm II gồm 14 dòng còn lại và chia thành ba nhóm phụ, trong đó, dòng L981-1-1 và L981-2-1 là hai hạt từ hai quả khác nhau nhưng lại giống nhau hoàn toàn (100%), tương tự dòng L981-3-1 và L981-4-1 cũng là hai hạt từ hai quả khác nhau nhưng cũng lại giống nhau hoàn toàn ở mức độ phân tử.