THIẾT KẾ VÀ ĐÁNH GIÁ KHẢ NĂNG ỨC CHẾ SUCCINATE DEHYDROGENASE CỦA CÁC DẪN XUẤT ALOE-EMODIN BẰNG PHƯƠNG PHÁP TÍNH TOÁN MÔ PHỎNG

Tóm tắt

Succinate dehydrogennase (SHD) là mục tiêu quan trọng trong kiểm soát và ức chế các loại nấm bệnh thực vật. Trong nghiên cứu này, bộ dữ liệu bao gồm 32 hợp chất đã được thiết kế dựa trên khung sườn aloe-emodin. Các nghiên cứu tính toán mô phỏng đã được dự đoán tương tác giữa các hợp chất này với SDH (PDB ID: 2FBW). Kết quả cho thấy các hợp chất thể hiện các tương tác mạnh với các amino acid tại vị trí hoạt động SDH. Năng lượng liên kết được dự đoán đều thấp hơn -6,0 kcal/mol, trong khi năng lượng liên kết của carboxin (hợp chất đối chứng) là -6,5 kcal/mol. Đặc biệt, dẫn xuất 05 (3-methyl-9,10-dioxo-9,10-dihydroanthrancene-1,8-diyl dibenzoate) có năng lượng được dự đoán thấp nhất là -10,5 kcal/mol (chênh lệch 4,0 kcal/mol so với carboxin). Do đó, hợp chất này được xem là tiềm năng cho các nghiên cứu tổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học (in vitro, in vivo) trong tương lai.